Gökhan Zan, 7 Eylül 1981 tarihinde dünyaya gözlerini açtı. Türk futbolunun eski milli oyuncularından olan Zan, kariyerine 1999 yılında Hatayspor'da başladı. Hatayspor formasıyla çıktığı 13 lig maçında 2 gol kaydetti. Daha sonra, 2000 yılında Çanakkale Dardanelspor'a transfer oldu ve burada 80 lig maçında forma giyip 10 gol attı.
2003-04 sezonunda Beşiktaş'a transfer olan Zan, 2004-2005 sezonunda Gaziantepspor'a kiralık olarak gönderildi. Beşiktaş'ta toplam 76 lig maçında görev alıp 4 gol atan Zan, 20 Haziran 2003 tarihinde Beşiktaş ile sözleşme imzaladı. Beşiktaş'la Türkiye Kupası'nı kazanan ilk oyunculardan biri oldu. Ancak, o sezonun bir kısmını Gaziantepspor'da kiralık olarak geçirdi.
2007-2008 sezonunda sakatlıklarla mücadele eden Gökhan Zan, kariyerinde ilk kez UEFA Şampiyonlar Ligi'nde yer aldı ve performansıyla birçok Avrupa kulübünün dikkatini çekti. 2008 Avrupa Futbol Şampiyonası'nda Türkiye Milli Takımı ile çeyrek finale yükselerek başarılı bir performans sergiledi.
2008-2009 sezonunda Beşiktaş'ta İbrahim Toraman ile savunmanın göbeğini oluşturarak takımının çifte kupa kazanmasına katkı sağladı. 2009-2010 sezonunda Beşiktaş ile olan sözleşmesi sona erdikten sonra, Gökhan Zan, Galatasaray'a transfer oldu.
2012-13 sezonunda Galatasaray'da Cris'in takıma katılmasıyla birlikte, adı birçok kulüple anılsa da Zan, Galatasaray'da kaldı. Milli takım kariyerinde 2 kez 19 yaş altı ve 7 kez 21 yaş altı milli takımlarda görev alan Zan, Türkiye'yi 2008 Avrupa Futbol Şampiyonası'nda temsil etti ancak 42 milli maçta gol atma başarısı gösteremedi.
Siyasi kariyerine gelince, Gökhan Zan, 22 Mart 2023 tarihinde İYİ Parti'ye katıldı. Ancak, 2023 Türkiye genel seçimlerinde milletvekili aday adayı olmasına rağmen seçilemedi. 27 Aralık 2023'te ise İYİ Parti'den istifa etti.